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食品微生物检验为食品监测必不可少的重要组成部分，它是衡量食品卫生质量的重要指标之一，也是判定被检食品能否食用的科学依据之一；通过食品微生物检验，可以判断食品加工环境及食品卫生环境，能够对食品被细菌污染的程度作出正确的评价，为各项卫生管理工作提供科学依据，提供传染病和人类，动物和食物中毒的防治措施；食品微生物检验是以贯彻“预防为主”的卫生方针，可以有效地防止或者减少食物中毒人畜共患病的发生，保障人民的身体健康，同时，它对提高产品质量、避免经济损失等方面具有重要意义。
检测项目
常规微生物指标（菌落总数、霉菌总数、大肠菌群等）、致病菌（沙门氏菌、大肠杆菌等肠杆菌、金黄色葡萄球菌、志贺氏菌、单核细胞增生李斯特氏菌、产毒霉菌等）、商业无菌、乳酸菌和双歧杆菌、寄生虫（贾第鞭毛虫、隐孢子虫、蛔虫卵死亡率等）。
检测产品
乳及乳制品、肉及肉制品、蔬菜及其制品、豆制品、糕点、饮用水等各类食品
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